การดำเนินงานเพื่อสร้างธุรกิจใหม่          ภารกิจหลักของ สนช. คือ การสร้างธุรกิจใหม่ หรือ "ธุรกิจนวัตกรรม" ให้เกิดขึ้นอย่างรวดเร็วและเป็นรูปธรรม ผ่านการเชื่อมโยง ส่งเสริมและพัฒนาโครงการนวัตกรรมร่วมกัน ระหว่างผู้จัดการโครงการของ สนช. ผู้ประกอบการ และภาควิชาการ ซึ่งนับเป็นพันธกิจที่ชัดเจนในการมุ่งเน้นให้การสนับสนุนภาคธุรกิจเอกชนเป็นหลัก อันเป็นจุดเด่นที่ทำให้ สนช. สามารถตอบสนองและสร้างความมั่นใจแก่ภาคเอกชนได้อย่างเต็มที่ ทั้งนี้กระบวนการสร้างธุรกิจนวัตกรรมของ สนช. นั้น จะประกอบด้วยระบบที่สำคัญ 6 ระบบ คือ          1. ระบบพัฒนาโครงการนวัตกรรม          2. ระบบจัดการทรัพย์สินทางปัญญา          3. ระบบสนับสนุนโครงการนวัตกรรม          4. ระบบการติดตามและประเมินผลโครงการนวัตกรรม          5. ระบบเผยแพร่ความสำเร็จของโครงการ          6. ระบบขยายผลโครงการนวัตกรรม